直答：兩本待遇不同，別當同一本用
把結論擺在最前面：
- 香港特區護照（HKSAR Passport）——菲方給予短期免簽入境待遇，現行為 14 天量級，適用於旅遊與短期訪問，具體以菲律賓移民局（BI）現行公告為準；
- BNO（British National (Overseas) 護照）——菲方將其作為英國國民（海外）證件處理，按 BI 對該類證件的現行分類適用相應的入境安排。它與特區護照不同軌，與英國公民（British Citizen）護照也不完全等同——BNO 持有人不是英國公民，個別以「公民」為條件的待遇未必覆蓋；
- 兩本證件的免簽天數與條件各自獨立、各自會變，甚至可能出現一本比另一本寬鬆的情形。行前查一次 BI 現行公告，按你打算用的那本查，不要拿另一本的待遇來推斷。
還有一條所有證件通用的底線：免簽或獲准入境的最終決定權在入境口岸的移民官，停留期以護照上的入境章為準。任何一本護照都不保證入境。
為什麼會不同：免簽名單認證件，不認「香港人」
理解了機制，就不會再糾結「同一個人為什麼兩種待遇」：
- 菲律賓的免簽與簽證政策是按旅行證件類別劃定的——名單上寫的是證件，不是持有人的出生地或居住地；
- 特區護照是中華人民共和國香港特別行政區簽發的旅行證件，菲方給它劃定了一檔待遇；
- BNO 是英國政府簽發給英國國民（海外）的旅行證件，菲方按英國證件體系給它歸類——而英國證件體系內部本身就分 British Citizen、British National (Overseas) 等多種身份，各國邊檢對它們的處理並不總是一致；
- 所以同一個人揣着兩本護照，在菲律賓邊檢眼裏就是兩個不同類別的旅行者。
這也解釋了為什麼網上「BNO 去菲律賓免簽 X 天」的帖子彼此矛盾——發帖人查的時點不同、混淆了 BC 與 BN(O) 的也不少。別抄帖子，查官方現行公告，按證件類別查。
入境該用哪本：多數場景，特區護照更省事
對絕大多數短期赴菲的港人，實務建議如下：
- 短期旅遊、探親、商務訪問：用特區護照。免簽機制明確、邊檢對這本證件熟悉、後續在 BI 辦延期的流程也最順；
- BNO 什麼時候有意義：如果你的整體行程圍繞 BNO 展開——例如從英國出發、機票與其他國家簽證都掛在 BNO 上——那麼全程用 BNO 保持一致，比中途換本更穩；
- 拿不準哪本待遇更好時：行前分別查兩本證件的現行安排，選定對這趟更有利的一本，然後從訂票那一刻起就只用它。
判斷標準其實只有一條：哪本護照能讓你這趟行程從訂票、值機、入境到離境全程只出現一個身份，就用哪本。省事從來不是省在入境那一刻，而是省在後面不用解釋。
兩本混用的風險：記錄對不上，麻煩在後頭
最容易踩的雷，是把兩本護照當「哪本方便用哪本」。典型場景與後果：
- 這次特區護照、下次 BNO——菲方系統裏出現兩條互不關聯的出入境記錄。單看每條都正常，合起來就是「查無此人卻似曾相識」：日後辦延期、9G 或其他長期簽證做背景核驗時，兩套記錄對不上，輕則被要求書面解釋、流程拖長，重則被懷疑隱瞞旅行史；
- 用 A 本入境、想用 B 本辦延期——行不通。延期、ACR I-Card、離境許可（ECC）全部跟着入境那本證件走，BI 只認你入境時使用的證件；
- 入境用 A 本、離境值機拿出 B 本——出入境記錄一邊有進無出、一邊有出無進，兩本的記錄同時殘缺，這是最難補救的一種。
如果過去已經混用過、擔心記錄有瑕疵，在下一次出行或申請長期簽證之前把問題主動處理掉——弄清兩本證件各自的出入境記錄狀態，必要時準備書面説明，比在櫃枱被問住強得多。個案情況複雜的，諮詢菲律賓執業律師或專業代辦，本文不替代法律意見。
以前混用過兩本，要辦 9G 或延期怕記錄對不上？→ 9G 與延期材料代辦
機票、eTravel、訂票信息：一致性是通關的命門
選定護照後，把「一致性」落實到每個環節：
- 機票——訂票時填寫的姓名拼寫、護照號、國籍欄，必須與你入境用的那本護照完全一致。BNO 與特區護照上的國籍表述不同、護照號也不同，訂票用 A 本資料、機場拿 B 本值機，櫃枱系統核驗對不上就可能被拒載；
- eTravel——菲律賓的電子入境登記按證件信息填報，用哪本入境就用哪本的資料填，二維碼截圖保存；在官方網站免費辦理，謹防收費仿冒站點；
- 酒店與租車等預訂——建議同樣用入境護照的姓名資料，查驗時少一層解釋；
- 同行家人——每人各自選定一本、各自貫徹，別出現「大人用特區護照、小孩用 BNO」這種給全家添堵的組合，除非孩子只有一本可用。
基本功還是那幾樣：護照餘期足夠（實務按六個月口徑把握）、回程或續程機票、住宿證明。材料齊、信息一致、答話具體，邊檢問不出問題。
辦居留時用哪本：一本貫穿始終
打算在菲律賓長住的港人——不管走 9G 工作簽、SRRV 退休簽、SIRV 投資簽還是 13A 婚姻居留——護照選擇要在申請前想清楚：
- 用哪本申請，就要做好長期用它的準備——居留身份、ACR I-Card、後續的年檢與續期都會掛在這本證件上，中途換證件雖非絕路，但要走變更手續、補一堆説明，能免則免；
- 選「記錄乾淨、且你會長期持有」的那本——考慮證件的換髮安排與你自己的身份規劃，選你未來五到十年都會穩定續期的那本；
- 入境身份與申請身份保持同軌——用特區護照免簽入境、隨後遞交長期簽證申請，是常規路徑；如果你計劃用 BNO 申請居留，那入境時就該用 BNO，讓記錄從第一天就長在同一本證件上；
- 換髮新護照（同一本證件類別的新舊更替）不算混用，帶着新舊護照去 BI 做信息更新即可。
如果你正處在「兩本護照、想長住菲律賓」的規劃口上——該用哪本入境、免簽期怎麼延、什麼時候切換到長期身份——可以委託易行辦理 9A 延期並把你的護照使用與居留路徑一次規劃清楚。我們按 BI 現行規則給方案：兩本證件各自的現行待遇查證後照實告訴你，審批與放行權在移民局與邊檢，沒有任何人能替它們承諾結果。